Optical Properties of the Bacteriochlorophyll a Within the B800 Part of Rhodoblastus Acidophilus Light-Harvesting Complex Studied Via Time-Dependent Density Functional Theory-Based Calculations

https://doi.org/10.22184/1993-7296.FRos.2025.19.4.304.311

Time-dependent density functional theory-based approaches, TD-DFT and TD-DFTB, are used to study the optical absorption of B800 part of light-harvesting complex 2 (LH2) of Rhodoblastus acidophilus. Calculated spectra for both single molecule and the optimized structure of B800 complex containing nine of such molecules are in qualitative agreement with experimental data. The absence of any sizable effects originating from the interaction between adjacent molecules are proved. Thus, optical features of B800 LH2 part are not connected to the structural organization of pigments. The importance of the time-dependent procedure for the correct description of BChl a absorption spectrum is demonstrated.

При помощи нестационарных расчетов на основе теории функционала плотности методами TD-DFT и TD-DFTB исследованы оптические свойства фрагмента B800 светособирающего комплекса 2 (LH2) Rhodoblastus acidophilus. Полученные в результате расчетов спектры поглощения как одиночной молекулы BChl a, так и оптимизированной структуры B800, состоящей из 9 молекул, качественно согласуются с экспериментальными данными. Доказано отсутствие значимых эффектов, обусловленных взаимодействием между соседними молекулами. Таким образом, спектральные особенности B800 не связаны со структурной организацией молекул пигментов. Показана важность нестационарных расчетов для корректного описания спектра поглощения BChl a.